Do najważniejszych zbiorów Muzeum Ziemi Piskiej należą bogate kolekcje flory i fauny w Puszczy Piskiej a także szereg cennych zabytków archeologicznych, etnograficznych oraz historycznych. W obiekcie muzeum można podziwiać okazałą dokumentację fotograficzną oraz piśmienniczą z dziejów regionu Warmii i Mazur. Wszystkie cenne zbiory muzealne podzielono na działy: Przyroda Mazur oraz Historia Ziemi Piskiej.
Muzeum Ziemi Piskiej często organizuje interesujące wystawy z zakresu przyrody bądź dziejów łowiectwa.
Jedną z nich, która na stałe udostępniona jest dla zwiedzających to wystawa "Zwierzęta Warmii i Mazur. co więcej muzeum od początku swojej działalności podejmuje liczne działania w celu popularyzacji wiedzy o regionie. Dlatego też w obiekcie często odbywają się spotkania kółek historycznych młodzieży a także organizowane są ciekawe konkursy i turnieje.